กรมการปกครองมีภารกิจในการควบคุมดูแลรักษาความสงบเรียบร้อยภายในพื้นที่พักพิงชั่วคราวฯ การป้องกัน สกัดกั้น จับกุม การจัดทำฐานข้อมูลและทะเบียนผู้หนีภัยฯ และผู้อาศัยฯ การเตรียมความพร้อมป้องกันและเผชิญเหตุสาธารณภัย การควบคุม กำกับดูแลให้ความช่วยเหลือผู้หนีภัยการสู้รบจากเมียนมาขององค์การนอกภาครัฐ การปฏิบัติการจิตวิทยาและการข่าว และการรายงานผลการปฏิบัติงาน ในพื้นที่ 4 จังหวัด 8 อำเภอ พื้นที่พักพิงชั่วคราวฯ 9 แห่ง มีผู้หนีภัยฯ และผู้อาศัยฯ 

โดยกรมการปกครองเป็นหน่วยปฏิบัติ มีหน้าที่ควบคุมดูแลผู้หนีภัยการสู้รบจากเมียนมาให้มีความปลอดภัย และรักษาความสงบเรียบร้อยตามนโยบายของรัฐบาล สำนักงานสภาความมั่นคงแห่งชาติ และกระทรวงมหาดไทย