พันธกิจ
1. สนับสนุนและส่งเสริมการบริหารกิจการด้านศาสนาอิสลามขององค์กรศาสนาอิสลามทุกระดับ
2. เสริมสร้างความสัมพันธ์อันดีระหว่างสมาชิกอาเซียนและประเทศมุสลิมทั่วโลก และสร้างความสัมพันธ์อันดีระหว่างชาวไทยมุสลิม ผู้นำศาสนากับทางราชการ ช่วยแก้ไขปัญหาความขัดแย้งอันเนื่องมาจากความเชื่อและความเห็นที่แตกต่างด้านศาสนา
3. สนับสนุนภารกิจเลขาธิการคณะกรรมการส่งเสริมกิจการฮัจย์แห่งประเทศไทย
4. อำนวยความสะดวกผู้ประสงค์เดินทางไปประกอบพิธีฮัจย์ ณ ประเทศซาอุดีอาระเบีย ทั้งระบบ
5. การพัฒนาและปรับปรุงระเบียบ/ข้อกฎหมาย ที่เกี่ยวกับการบริหารองค์กรศาสนาอิสลามและส่งเสริมกิจการฮัจย์
6. บูรณาการการปฏิบัติงานอื่นๆ ร่วมกับหน่วยงานที่เกี่ยวข้องตามที่ได้รับมอบหมาย